于2002年正式成立，立足新疆、面向全国提供事前咨询、事中监理、事后等保、维保、后评价等信息系统咨询和安全测评服务。截至2019年末，服务过的客户单位近800个，承接1600多个信息化建设项目，承接项目总投资额超过227亿。

于2002 年3 月28 日，在原中国科学院新疆物理研究所和原中国科学院新疆化学研究所 （均于 1961 年成立） 的基础上整合成立，为中国科学院在新疆部署的重要国家战略科技力量。截止2021年，新疆理化所共有在研项目1830项。

于2021年成立，位于新疆维吾尔自治区乌鲁木齐市，是一家以从事研究和试验发展为主的企业。